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/ Aminet 6 / Aminet 6 - June 1995.iso / Aminet / misc / sci / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00617 < prev    next >
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Text File  |  1995-03-04  |  1.5 KB  |  33 lines
  1. ****************************
  2. * Transthyretin signatures *
  3. ****************************
  4.  
  5. Transthyretin (prealbumin) [1] is a thyroid hormone-binding protein that seems
  6. to transport thyroxine (T4) from the bloodstream to the brain. It is a protein
  7. of about  130  amino  acids that  assembles as a homotetramer and  forms    an
  8. internal channel that binds thyroxine. Tranthyretin is  mainly synthesized  in
  9. the brain  choroid  plexus.  In humans, variants of the protein are associated
  10. with distinct forms of amyloidosis.
  11.  
  12. The sequence of transthyretin is highly conserved in vertebrates.  We selected
  13. two regions  as  signature  patterns.  The  first  located  in  the N-terminal
  14. extremity is  centered  on  a  lysine  known to be involved in binding T4. The
  15. second pattern  is  located  in  the  C-terminal  extremity  and  contains two
  16. residues also involved in T4-binding.
  17.  
  18. -Consensus pattern: S-K-C-P-L-M-V-K-V-L-D-A-V-R-G
  19.                     [The second K binds thyroxine]
  20. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  21. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  22.  
  23. -Consensus pattern: S-P-[FY]-S-Y-S-T-T-A-[LIVM]-V-[ST]-x-P
  24.                     [The third S and the second T bind thyroxine]
  25. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  26. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  27.  
  28. -Last update: December 1992 / First entry.
  29.  
  30. [ 1] Duan W., Achen M.G., Richardson S.J., Lawrence M.C., Wettenhall R.E.H.,
  31.      Jaworowski A., Schreiber G.
  32.      Eur. J. Biochem. 200:679-687(1991).
  33.